سنتز و شناسایی ترکیبات جدید فسفرآمید و مطالعه اثر بازدارندگی آنها در مقابل ویروس‌های کرونا و آبله میمون با استفاده از روش داکینگ مولکولی

نوع مقاله : مقاله علمی پژوهشی

نویسندگان

دانشکده شیمی، دانشگاه سمنان، سمنان، ایران

چکیده

در چند سال اخیر، دو بیماری ویروسی-عفونی کرونا و آبله میمون و تهیه ترکیبات با خاصیت بیولوژیکی مناسب به عنوان دارو جهت بازدارندگی و مقابله با این بیماری‌ها توجه جامعه پزشکی و سازمان جهانی بهداشت را به خود جلب کرده است. از جمله ترکیبات شیمیایی که تاکنون خاصیت بیولوژیکی و دارویی مناسبی در برابر انواع بیماری‌ها از جمله سرطان، هپاتیت و کرونا از خود نشان داده‌اند، ترکیبات فسفرآمیدی با اسکلت اصلی O═P─N می‌باشند. از این رو، در کار حاضر، سه ترکیب جدید فسفرآمیدی شامل [OCH2C(CH3)2CH2O]P(═O)[NHC6H4(3-F))] (ترکیب ۱)، [(4-Cl)C6H4O]P(═O)[3-(NH)C5H4N]2 (ترکیب ۲) و [(3-F)C6H4NH]P(═O)[2-(NH)C5H4N]2 (ترکیب ۳) تهیه و شناسایی شدند و به‌عنوان مدل‌ برای انجام شبیه‌سازی داکینگ مولکولی جهت پیش‌بینی اثر بازدارندگی این ترکب‌ها در مقابل دو ویروس‌ کرونا (پروتئین‌ها با کدهای 6LU7 و 6M03) و آبله میمون (4QWO و 8CER) مورد استفاده قرار گرفتند. یافته‌ها نشان می‌دهند که ترکیب‌های مورد مطالعه با دارا بودن میل اتصال نسبتا بالا به گیرنده‌های پروتئینیِ ویروس کرونا (با انرژی‌های اتصال حدود ۷– کیلوکالری بر مول) می‌توانند در مهار ویروس کرونا مؤثر باشند. در مورد ویروس آبله میمون، انرژی‌های اتصال پروتئین-لیگاند مقادیر منفی (حدود ۸– کیلوکالری بر مول) را نشان می‌دهند که تائیدکننده اتصال پایدار و مطلوب بین پروتئین هدف با لیگاند است. بنابراین، ترکیبات مورد مطالعه 1 تا 3 می‌توانند به عنوان کاندید برای مقابله با ویروس‌ آبله میمون پیشنهاد شوند.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Synthesis and Characterization of New Phosphoramide Compounds and Study of Their Inhibitory Effects Against Corona and Monkeypox Viruses by using Molecular Docking Method

نویسندگان [English]

  • Atekeh Tarahhomi
  • Zeinab Gholamrezaeia
Department of Chemistry, Semnan University, Semnan, Iran
چکیده [English]

In recent years, two infectious viral diseases, Corona and Monkeypox, and preparation of compounds with suitable biological properties as drugs to inhibit these diseases have attracted attention of the medical community and World Health Organization. Phosphoramide compounds with the main O═P—N skeleton are among chemical compounds that have shown appropriate biological and medicinal properties to treat with various diseases such as cancer, hepatitis and corona. In present work, three new phosphoramide compounds including [OCH2C(CH3)2CH2O]P(═O)[NHC6H4(3-F)] (compound 1), [(4-Cl)C6H4O]P(═O)[3-(NH)C5H4N]2 (compound 2) and
[(3-F)C6H4NH]P(═O)[2-(NH)C5H4N]2 (compound 3) were prepared and characterized, and were used as model for molecular docking simulation to predict their potential inhibitory against corona (PDB IDs: 6LU7 and 6M03) and monkeypox (4QWO and 8CER) viruses. Obtained results show that the studied compounds having relatively high binding affinity with protein receptors of coronaviruse (with binding energies of about 7 kcal/mol) can be effective to control coronavirus. In the case of monkeypox, binding energies of ligand-protein complex (about 8 kcal/mol) illustrate negative values showing a stable and favorable binding connection between target protein with ligand. So, the studied compounds 1 – 3 can be suggested as candidates to inhibit corona and monkeypox viruses.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Phosphoramide
  • Coronavirus
  • Monkeypox
  • Molecular docking